FAT (FAT 16) — файлова система, що найбільше підходить для більшості дисків, що працюють не тільки з Windows XP або Windows 2000, але і з операційними системами сімейства Windows більш ранніх версій, а також з платформами MS-DOS і OS/2.
Як краще використовувати NTFS: Виходить, що NTFS краще всього підходить для встановлення операційної системи Windows та сумісних із нею додатків. На накопичувачах з такою файловою системою можна зберігати і мультимедіа-файли, але подивитися їх вийде лише на комп'ютері або Xbox One.
Файлова система FAT32 не дозволяє зберігати окремі файли розміром понад 4 ГБ, а система NTFS дозволяє. У порівнянні із системою FAT32, файлова система NTFS найефективніше використовує диск і керує дисковим простором. Швидкості зчитування та запису вище у системи NTFS.
Основною перевагою exFAT перед NTFS є швидкість функціонування. Тобто, exFAT працює швидше, ніж NTFS. Ефективність операції «запису» в exFAT збільшується рахунок зменшення накладних витрат файлової системи. Однак, exFAT не має багато корисних характеристик, які властиві NTFS.