При правильному лікуванні хвороба триває від 10 до 20 днів (залежно від збудника хвороби) і зазвичай закінчується повним одужанням. Хронічний пієлонефрит може бути наслідком переходу гострого пієлонефриту в хронічну стадію або від початку виникати як первинний хронічний процес.
Повністю вилікувати хронічний пієлонефрит неможливо: рецидив може статися через переохолодження або в міжсезоння: навесні/восени. Якщо хвороба загострюється більше двох разів на рік, слід приймати антибактеріальні препарати у знижених дозах та вдатися до фітотерапії.
Чи можна зняти діагноз ? Як правило, якщо протягом 5 років рецедіва пієлонефриту не виявлено, знімають з обліку.