Фонд реалізує наступні програми: Програма «Іношкільник». Програма спрямовано залучення молоді шкільного віку в інноваційну діяльність.
Програма спрямовано підтримку комерційно орієнтованих науково-технічних проектів молодих дослідників. Брати участь у конкурсі з даної програмі можуть фізичні особи, від 18 до 30 років включно, які є громадянами РФ, і які раніше не перемагали в програмі.
Програма "Кооперація" спрямована на розвиток партнерства між малими інноваційними підприємствами та Індустріальними партнерами.